司令喜欢在电脑上玩偷菜游戏，甚至还去偷他女儿的菜；即使H市出现了尸兄瘟疫的危机，他还能够在京城淡定地玩偷菜游戏。

司令正在玩偷菜游戏时，有人进来报告说林珑带着蓝海、尔多等人去H市了。司令听了很生气，便让H市的特能队员把她绑回去。然后杀了给林珑打电话，但林珑不接，反而让尔多去接。

尸王大闹撤离点后，蓝海把事情通知了司令。司令便乘坐星空战舰·天狼星从京城出发前往H市，并带上了不朽大师和尼玛，请求不朽大师复原林珑。为了对付尸王，他还带上了炎黄特能队第二小队。此后司令还在H市通过影像见过白小飞，看见蓝海和他有过接触。

炎黄军方来到H市，使用了巳蛇清除尸兄。尸王从图书馆出来前往发电厂的路上，司令派了军队去拦截，自己在天狼星号里坐镇指挥。看见尸王不怕Y7穿甲弹，司令被尸王不死的能力吓到了，并确认了他感染源的身份，又命令天狼星号发射炮弹攻击。尸王反击，司令发现林珑的激光炮被尸王改造使用了。炎燕面对尸王时，司令收到巳蛇受到攻击的报告，便让AI切换画面，看见变异的尔多、鬼棍、邪罗汉摧毁了造价超亿的巳蛇，司令连连叹息。

随后二队与尸王展开战斗，司令则观战。最终二队活捉了尸王，把他带到了天狼星号里，便去见司令了。结果尸王逃了出来并杀死了大量士兵，还把特能二队击成重伤。司令只好拜托不朽大师出战。

不朽大师打跑尸王和东瀛忍者后回到天狼星号，司令向他表示了谢意。司令还发现自己低估了感染源实力，便回京都重新制定下一步计划。

司令和炎燕找到了京城的金半仙算卦，金半仙便答应给炎黄算三卦。金半仙用“靇眼”算出大劫将至，并画下了两个关键人物白小飞和另一个“白小飞”。司令拿起画了白小飞的画，表示自己在H市通过影像见过他。随后司令派了苏坡猫带人去L市找白小飞。

司令得到尸王要统治地球的消息后，在各地建立了地下避难所，定时筛查水源，并让特能队和特种部队做好了准备，还一一通知了其他国家。

只剩五天时，司令问青龙和死绳是否探查到尸王的消息，得到了否定的回答。忽然炎燕在南海找到了一个有大量变异体的岛并报告了司令，司令便派所有一队成员立即前往。随后木犀赶来向司令报告说东瀛已经爆发感染，司令非常惊讶。

由于意外，全世界爆发病毒比预期早了前三天。炎燕向司令汇报了各种情况，司令便让大型地下安全屋投入使用，并让炎燕通知京城的四个九级猎人协助守住京城。

尸王和空凰来到炎黄皇宫后与黑虎骚博、一眉道长短暂交手后，尸王跳了下去，而导弹车发射的导弹奈何不了空凰，司令便让炎黄特能三队去对付空凰和他带领的那群鸟型尸兄。另一方面炎黄军方也联系到了藏区不朽大师处，并说了“白小飞”的重要性，并派了飞行机甲去接他们。

两个“白小飞”都快来到京城时，司令对他们名字一样感到奇怪，并和炎燕、蓝海交流讨论了情报，决定“先灭尸王，再灭尸兄”。尸兄进攻武神阁之后，炎燕向司令报告了这件事。

黑虎骚博等人纷纷燃烧生命与尸王战斗时，司令组织了红鹰狙神队对付尸王，却发现下雨了，就让大家先全部待命。在一眉道长献祭燃烧将尸王带向高空的时候，司令让三队队员立即离开天空领域。在青龙与尸王战斗时，尸王利用自然界的雷电来为自己战斗，外加上之前打的降雨弹，不禁感叹尸王的科技已经走在炎黄前面了，“就怕流氓有文化”。尸王产生球状闪电后，司令颤抖着，担心着整个京城和青龙的安危。

地狱之门因圣主之死而门户大开时，司令和机械鬼警一起指挥“泰坦号”的管道系统封锁大门，并用两颗超量核武干掉了刚出门的撒旦。随后尸王就从地狱之门出来了，正要进食撒旦，司令见识过尸王的可怕，急忙下令发动攻击，但泰坦号上的操作员在打出一发超量核武后认为这样就能杀死尸王，掉以轻心，被尸王钻了空子，尸王用超音蜂鸟毁掉了核武库，又将守卫战舰的S级战士尸化控制。司令见状打算亲自出马，九级猎人狂出手拦住尸王，并让司令快跑。

但狂即使使出生命燃烧·烈阳九珠也没能干掉尸王，反而被尸王废了一条腿，随后而来的金狮谜语和沙皇一起对付尸王，又被太空旅人阻挠。司令决定用出万龙魔心塔，与万龙融合，对抗太空旅人。司令将万龙兽甲变化成鲸鱼的样子，将太空旅人吞入腹中，太空旅人用重力潮涌波挣脱。这时尸王也赶了过来，和太空旅人合力斩断司令和万龙的链接，并将万龙吞噬。司令战败落入水中，被冉爱国和白小飞救下。

司令昏倒后被腾龙战舰收治，醒来后和白小飞进行对话，得知了尸王被无忧打落到神级境界和吞噬徐福的暗日星基因的事。

冉爱国去烈士陵园拜祭祖先时，司令和白小飞也来了，司令解开了炎黄守护“星龙”的墓穴封印，将夺星链交给白小飞后，三人一起离开陵园。