出土遗物中如觚、觯、尊、簋、瓦足盘以及拍印的云雷纹等特点与中原地区河南偃师二里头、郑州二里岗的夏商文化有紧密的联系，其年代应相当于夏商时代。

对良渚文化的影响。在地域上，马桥文化与良渚文化也处于同一分布范围。在浙南、闽北等地区的影响。几何形纹陶与良渚文化诸陶系相比，制法、造形或纹饰等都发生了突变。而拍印篮纹或绳纹的印纹陶，在福建闽侯县昙石山遗址中层新石器时代文化中已经出现，在浙南江山地区，还发现可与新石器时代相接，而器型与马桥文化极为相似的遗存。据此，马桥文化的几何印纹陶，可能是受浙南、闽北印纹陶遗存影响的产物。

在中原地区影响。石器中，除了柳叶形或菱形带铤或带翼的石镞外，还出现大量的扁平三角形石镞。陶器中，压印的带状云雷纹与商代早期的文化极为相似。所以，马桥文化也有可能是受中原地区文化影响的产物。可以从上海金山的亭林遗址上层文化遗存中找到它的脉络。亭林文化各类器物，石镰和三角形带柄石刀，显然与马桥文化一脉相承。

遗址遗存出土文物有石、玉、陶、骨和铜器文物500余件。马桥文化陶器有三大陶系。夹砂绳纹（或篮纹）红陶约占25.9%，器形主要是鼎足，有凹弧形、圆锥形和舌形3种。其次为甗和釜，甗是连成一体的甑和鼎的组合，炊器中鬲一件未见。呈各种陶色的印纹陶（有浅黄、橙紫红、紫褐色），约占41.1%，纹饰有脉纹、篮纹、席纹、方格纹、回字纹、云雷纹等，器内壁都留有填印窝；底部都是圆底内凹，有折沿弧腹的罐和盆、带圆把的杯和鸭形壶等器形。

在这些器物的唇沿上，有的注有一个或数个相同的刻划符号。灰陶、黑衣陶和黄衣灰陶，约占33%。都是平底或圈足器，器唇以素面为主，有的在肩腹部压印一条带形的云雷纹或鱼鸟纹，器有觚、觯、尊、豆、簋、瓦足盘、袋足盉和澄滤器等。上列各陶系陶器的制法，前两种为泥条盘筑法加轮修，后一种为轮制。

马桥文化的遗存在杭嘉湖地区都有分布，由于一些客观上的原因，对浙江境内的马桥文化研究不够深入。平湖地区以往曾有一些马桥文化的遗物出土，但缺乏原生的地层堆积。2004年底至2005年春，为配合07省道（平湖段）的改线工程，由浙江省文物考古研究所和平湖市博物馆组成联合考古队，对工程涉及的图泽遗址进行了抢救性考古发掘。

图泽遗址的发掘，除了发现了崧泽文化的堆积和良渚文化的墓地之外，重要的是发现并确认了马桥文化的堆积。图泽遗址马桥文化遗存的发现，是马桥文化考古发掘研究的一个重要收获，同时也为我们进一步研究平湖地区史前历史提供了不可多得的资料。

马桥文化有一个奇特的返祖现象：即在其他地区良渚文化晚期出现的许多耗工费时的稀世珍品，包括玉器，带细刻图案的陶器、象牙器，在马桥古文化遗址中均未发现，遗存只是些粗陋的陶器杂件。同时，作为马桥文化原始文字的形器结构和表意方式，比上距千年的良渚文字更为简单。这种现象，考古界认为除社会发展因素外，很大程度是受生态环境的影响。

新石器晚期气候变暖，海平面上升，致使发生一次大规模的海浸。沿海先民不得不离开故土，远走他地。这一地区众多聚落荒废，人大批死亡，造成马桥文化突然衰落，与良渚文化风格传统渊源相中断。