粘膜由上皮和固有层组成。上皮为假复层纤毛柱状，由纤毛细胞、杯状细胞、刷细胞、基细胞和小颗粒细胞等组成。

纤毛细胞：呈柱状，游离面有密集的纤毛，纤毛向咽部快速摆动，将黏液及附着其上的尘埃、细菌等推向咽部被咳出，净化吸入的空气。

杯状细胞：分泌粘蛋白与混合腺的分泌物在上皮表面构成粘液性屏障，可粘附空气中的异物颗粒，溶解有毒气体等。

小颗粒细胞：内分泌细胞，内含5-羟色胺等物质，可调节呼吸道平滑肌的收缩和腺体的分泌。

基细胞：干细胞，呈锥形。

固有层结缔组织中有较多弹性纤维，也常见淋巴组织，具有免疫防御功能。其中的浆细胞与上皮细胞联合分泌sIgA，释放入管腔，可抑制细菌繁殖与病毒复制。

粘膜下层 为疏松结缔组织，内有较多混合性腺。