2011年，入选第三届国务院侨办海外专家咨询委员会

2011年，北京大学优秀校友

2012年，当选美国计算机协会会士(ACM fellow )

2013年，担任国际交叉科学研究院大数据科学与工程国际研究中心主任。

2013年，中国海外交流协会第五届理事会理事。

2015年，获得欧洲研究委员会ERC Advanced Fellowship。

2015年，获ACM PODS Alberto O. Mendelzon Test-of-Time Award（ACM PODS十年最佳论文奖）

2017年，获2017ACM SIGMOD会议最佳论文。

2017年，当选欧洲科学院院士。

2017年，获得VLDB会议最佳系统演示奖

2018年，当选为英国皇家学会院士。

2018年，获得英国皇家学会Wolfson研究成果奖。

2018年，获2017 ACM SIGMOD Research Highlight Award, 2018

2018年，创办深圳计算科学研究院并担任首席科学家

2019年，受聘清华大学杰出访问教授 。

2019年，当选为中国科学院外籍院士。

2020年，获CCF“海外杰出贡献奖”。

2023年，当选为英国皇家工程院院士

樊文飞长期从事大数据、数据库理论和系统的研究。英国皇家学会称“他规范了大数据查询问题，提出了全新的大数据计算方法，突破了传统数据库系统的局限”，“对数据质量领域做出开拓性贡献并在工业界产生广泛影响”，“推动了半结构化数据的研究”。他创立大数据计算易解类理论，奠定了大数据复杂性研究的基础；实现图算法的自动并行化，简化了大规模图计算程序设计、调试和分析；提出有限资源下的大数据可计算理论与方法，为资源受限用户实现大数据分析提供了基础。他重构了数据质量五个核心问题的理论，提出的一系列数据清洗技术大幅提高了语义错误处理能力，并首次为关键数据修复提供了正确性保证。他开辟了半结构化数据约束研究领域，定义的XML约束语言被纳入 W3C标准，并建立了推理系统，对Web数据管理产生了深远影响。他是国际上囊括了数据库理论与系统顶级会议最佳论文或时间检验奖的两位学者之一，被誉为“极少数在数据库理论及系统两方面都做出突破性贡献的世界级科学家之一”。

截至2021年3月，樊文飞在国际计算机学术刊物和学术会议上发表论文近190篇。

截至2020年，樊文飞先后获得英国工程与物理科学研究基金、加拿大国家研究基金、英国工程与物理科学研究基金、美国国家科学基金、英国生物技术和科学基金、英国工程与自然科学研究理事会、英国工程与自然科学研究理事会（EPSRC）后续基金、英国爱丁堡皇家学会—国家自然科学基金委员会联合项目、欧洲研究理事会卓越贡献奖等项目支持。

截至2020年，樊文飞的团队已经获得国际数据库领域四大学术会议等8个奖项，包括5项数据库四大顶级理论和系统会议的最佳论文奖和时间检验奖（SIGMOD 2017, PODS 2015 和 2010, VLDB 2010, ICDE 2007），最佳论文Runner up奖牌（ICDE 2014）和最佳系统演示奖（VLDB 2017）等。

樊文飞积极参与中国科技与教育事业。2009-2019年，他每年在国内工作6个月以上，在北大、北航等处授课，举办30多场交流讲座，培养出杰青、阿里达摩院高级技术专家等杰出人才。

樊文飞与国内学者合作，共同在大数据分析、并行计算、数据质量等研究领域做出国际领先的成果，为中国首获国际数据库顶级会议SIGMOD、VLDB最佳论文等五项国际奖。

樊文飞还兼任北航客座教授、北大深研院南燕荣誉教授、清华大学杰出访问教授、国务院侨办海外咨询专家和中国侨联特聘专家，为中国学科建设、人才培养和科技发展献策献力。

樊文飞积极推动中英两国在技术领域开展实质性合作，参与中国科研与教育事业，并积极参加和支持中国计算机学会的工作，为推动中国计算机学科发展及促进国际交流合作做出了重大贡献。（北京大学校友网评）

樊文飞是国际学术界公认的数据库理论与系统并重的第一人，是世界上极少数同时在两个领域做出突破性贡献的学者之一。（清华大学新闻网）

樊文飞是国际公认的数据库领域极少数理论与系统双栖的顶级专家，在大数据计算、数据质量和半结构化数据的基础理论、算法与应用领域做出了杰出贡献。他奠定了大数据计算复杂性的基础，重塑了数据质量研究领域，并开创了半结构化数据约束理论的研究方向。是国际数据库领域历史上仅有的两个“大满贯”得主之一。（北京大学深圳研究生院评）